保育重點
- 維持平原與河口連續性濕地環境,以及冬季遷移性水鳥棲地
- 改善與維護獨流溪環境,確保洄游生物廊道通暢與棲地品質
- 維護山麓湧泉區的里山環境及生物
關注動物
麝香貓、食蟹獴、臺灣野兔、董雞、山麻雀、林鵰、黃魚鴞、環頸雉、遷徙性水鳥(如鷺科、雁鴨科、鷸鴴科等)、柴棺龜、中華青鱂、菊池氏細鯽、高體鰟鮍、臺灣梅氏鯿、大口湯鯉、洄游性生物(如日本鰻、鱸鰻、日本瓢鰭鰕虎、兔頭瓢鰭鰕虎、寬頷瓢鰭鰕虎、明仁枝牙鰕虎等)、臺灣扁絨螯蟹、印度刁蠻蟹、毛足圓軸蟹
關注植物
石龍尾、水社柳、水蕨、水虎尾、小埤薹、卵葉水丁香、大偽針茅、東方莢果、九州耳蕨、石薺薴、連萼穀精草、細葉金絲桃、水車前、禾草芋蘭、臺東鐵桿蒿、茵陳蒿、列當、芫花、紫芋蘭、臺灣白及